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Le département de gastroentérologie d'Ichilov est certifié par le Conseil européen de gastroentérologie et d'hépatologie.
Le département est spécialisé dans le traitement des troubles gastro-intestinaux, des tumeurs du système digestif, des inflammations intestinales et d'autres maladies.
Le Département comprend des unités de gastro-entérologie pédiatrique, d'hépatologie et de gastro-entérologie invasive. Le Centre de traitement de l'obésité hépatique relève du Département. C'est la seule institution de ce type en Israël.